1. 標(biāo)本的采集
正常動(dòng)物細(xì)菌檢測(cè)主要檢查呼吸道和腸道，分別取氣管分泌物及腸內(nèi)容物做細(xì)菌培養(yǎng)檢查。對(duì)于發(fā)病動(dòng)物，采取其病變組織和臟器做細(xì)菌學(xué)檢查。
2. 細(xì)菌的培養(yǎng)
細(xì)菌是單細(xì)胞的原核生物，絕大部分都可以在人工培養(yǎng)基上進(jìn)行繁殖，只有少數(shù)例外，如泰澤病原體需在活細(xì)胞中繁殖。不同細(xì)菌種類(lèi)所要求的zui適生長(zhǎng)條件不盡相同，有些細(xì)菌需在有氧的環(huán)境下才能生長(zhǎng)，稱(chēng)為需氧菌；有些只能在無(wú)氧環(huán)境下生長(zhǎng)，稱(chēng)為厭氧菌；還有一些細(xì)菌在有氧、無(wú)氧環(huán)境下都可以生長(zhǎng)，稱(chēng)為兼性厭氧菌。
培養(yǎng)細(xì)菌的目的，是從不純的被檢材料中找出特定的細(xì)菌或全部細(xì)菌，這一過(guò)程稱(chēng)為分離培養(yǎng)。如果只是培養(yǎng)性質(zhì)明確的一種細(xì)菌，則稱(chēng)為純培養(yǎng)。為了從被檢材料中分離出所要檢查的細(xì)菌，可以利用多種性質(zhì)不同的選擇性培養(yǎng)基，檢查各種不同的目的細(xì)菌。
（1）培養(yǎng)基的種類(lèi)：按物理性狀可把培養(yǎng)基分為液體培養(yǎng)基、半固體培養(yǎng)基和固體培養(yǎng)基三種。
（2）細(xì)菌培養(yǎng)的方法：培養(yǎng)細(xì)菌的目的不同，其方法也不盡相同，通常把細(xì)菌的培養(yǎng)方法分為一般培養(yǎng)法、二氧化碳培養(yǎng)法和厭氧培養(yǎng)法三種：
①一般培養(yǎng)法 一般培養(yǎng)法又稱(chēng)需氧培養(yǎng)法，將已接種好的平皿、斜面或液體培養(yǎng)基等，置于37℃孵育箱內(nèi)培養(yǎng)18～24h，一般細(xì)菌即可于培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。但也有少數(shù)生長(zhǎng)緩慢的細(xì)菌，需培養(yǎng)2～7d甚至更長(zhǎng)時(shí)間才能生長(zhǎng)。
②二氧化碳培養(yǎng)法 某些細(xì)菌如腦膜炎奈毖氏菌、布魯桿菌及肺炎支原體等，需要在一定的二氧化碳環(huán)境下才能良好生長(zhǎng)，即二氧化碳培養(yǎng)法，常用的有二氧化碳培養(yǎng)箱、燭缸法、重碳酸鈉—鹽酸法。
③厭氧培養(yǎng)法 有些細(xì)菌只能在無(wú)氧環(huán)境下生長(zhǎng)，即厭氧培養(yǎng)法，目前常用的厭氧培養(yǎng)法有厭氧罐法、氣袋法及厭氧箱等。
3. 細(xì)菌的鑒定和分類(lèi)
把獲得純培養(yǎng)的細(xì)菌進(jìn)行一系列生物學(xué)特性的檢查，并確定其分類(lèi)學(xué)上的位置，這個(gè)過(guò)程叫細(xì)菌鑒定。細(xì)菌生物學(xué)性狀包括菌落形態(tài)、菌體形態(tài)、染色性質(zhì)、生化反應(yīng)以及血清學(xué)反應(yīng)特性和特異性噬菌體等。
細(xì)菌的分類(lèi)是根據(jù)其營(yíng)養(yǎng)方式及各種生物學(xué)特性親緣關(guān)系，將細(xì)菌劃分為不同的門(mén)、綱、目、科、屬、種，其基本分類(lèi)單位是種。
（1）菌落形態(tài)：菌落的特征是識(shí)別細(xì)菌的重要依據(jù)，觀察菌落特征時(shí)應(yīng)注意：邊緣是整齊的、還是鋸齒的，表面是光滑的、還是粗糙的，中間是突起的、還是凹陷的，是透明的、還是半透明或不透明的。如乙型溶血性鏈球菌，在血瓊脂平皿上，菌落灰白色，圓形，中央稍凸起，透明或半透明，表面光滑，菌落周?chē)梢?jiàn)透明的溶血環(huán)。而綠膿桿菌，在選擇性培養(yǎng)基（NAC）上菌落扁平，邊緣不整齊，大小不一，表面濕潤(rùn)、有光澤，菌落周?chē)兴{(lán)綠色或褐色色素?cái)U(kuò)散，但也有不產(chǎn)生色素的菌株。這些菌落特征在細(xì)菌的鑒定中均有一定意義。
（2）細(xì)菌的生化反應(yīng)特性：各種細(xì)菌具有各自*的酶系統(tǒng)，因而在代謝過(guò)程中所產(chǎn)生的分解與合成代謝產(chǎn)物也不同。這些代謝產(chǎn)物又各具不同的生化特點(diǎn)。根據(jù)此特點(diǎn)，利用生物化學(xué)方法來(lái)鑒別不同細(xì)菌，稱(chēng)為細(xì)菌的生化反應(yīng)試驗(yàn)。生化反應(yīng)試驗(yàn)方法很多，主要有以下幾種：
①糖（醇）類(lèi)發(fā)酵試驗(yàn)：是鑒定細(xì)菌的生化反應(yīng)試驗(yàn)中zui主要的試驗(yàn)，不同細(xì)菌可發(fā)酵不同的糖類(lèi)，如沙門(mén)菌可發(fā)酵葡萄糖，但不能發(fā)酵乳糖，大腸桿菌則可發(fā)酵葡萄糖和乳糖；即使兩種細(xì)菌均可發(fā)酵同一種糖類(lèi)，其發(fā)酵結(jié)果也不盡相同，如志賀菌和大腸桿菌均可發(fā)酵葡萄糖，但前者僅產(chǎn)酸，而后者則產(chǎn)酸、產(chǎn)氣，故可利用此試驗(yàn)鑒別細(xì)菌。
②葡萄糖代謝類(lèi)型鑒別試驗(yàn)：可用于葡萄球菌與微球菌的鑒別。
③β-半乳糖苷酶試驗(yàn)（ONPG）：分解乳糖的細(xì)菌ONPG試驗(yàn)為陽(yáng)性，如埃希氏菌屬、枸櫞酸桿菌屬、克雷伯菌屬和沙雷氏菌屬等。而不發(fā)酵乳糖的細(xì)菌如沙門(mén)菌、變形桿菌和腸桿菌科中其他不發(fā)酵乳糖的細(xì)菌ONPG試驗(yàn)均為陰性。
④其他生化試驗(yàn)：如淀粉水解試驗(yàn)、七葉苷水解試驗(yàn)、甲基紅試驗(yàn)及VP試驗(yàn)等。
（3）革蘭氏染色法：染色除能觀察細(xì)菌形態(tài)外，還可根據(jù)其染色反應(yīng)，將細(xì)菌分為革蘭氏陽(yáng)性和革蘭氏陰性菌兩大類(lèi)。如沙門(mén)菌屬、志賀菌屬、巴斯德桿菌及耶爾森菌等均為革蘭氏陰性菌，革蘭氏陽(yáng)性菌有肺炎鏈球菌、單核細(xì)胞增生性李斯特桿菌、金黃色葡萄球菌、鼠棒狀桿菌等。
（4）血清學(xué)鑒定：除生化鑒定外，必要時(shí)可進(jìn)行血清學(xué)鑒定。如沙門(mén)菌屬、志賀菌屬、綠膿桿菌、耶爾森菌等均可做血清學(xué)分型試驗(yàn)。